Pixel Samurai oyununda, cesur bir samurayın suçlu çetelerine karşı savaşmasına yardım etmeniz gerekecek. Önünüzdeki ekranda, yol boyunca yavaş yavaş hızlanarak koşacak olan karakteriniz tarafından görülecektir. Kahramanın yolunda, samurayın hepsini aşmak zorunda kalacağı çeşitli engeller ve tuzaklar olacak. Rakiplerle tanışan samurayınız, koşarken bir kılıçla saldırmak ve böylece karşılaşılan tüm rakipleri yok etmek zorunda kalacak.