Farklı canavarlarla savaşmak için özel bir ordu oluşturmanız gerekir, bu nedenle Level Up Mutants oyununda çeşitli mutant türlerinin seçimiyle meşgul olacaksınız. Önünüzdeki ekranda kahramanınızın koştuğu yolu görebilirsiniz. Koşusunu kontrol ederek çeşitli engellerden ve tuzaklardan kaçınırsınız. Yolda duran nesneleri fark ederseniz onları kaldırın. Ayrıca yeşil güç alanlarını kullanarak karakteri kontrol eder. Bu, karakterinizi değiştirecek ve onu bir mutant yapacaktır. Yolun sonunda mutantınızla savaşacağınız bir canavar sizi bekliyor. Canavarları yenmek size Mutantların Seviyesini Yükseltmede puan kazandırır.